研究院建设总体思路和目标是：以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入实施创新驱动发展战略，面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向企业创新发展需要，加速推动学科链、人才链、产业链、创新链“四链” 深度融合，促进人才-项目-平台-团队相互赋能，强化应用技术创新、打通转移转化通道、提升创新主体能级、集聚资源要素赋能、深化开放创新协同，推进科技体制机制创新、强化产业技术供给、促进科技成果转化、推动科技创新和经济社会发展深度融合。充分发挥学校国家一流学科和省级重点学科建设、国家级和省部级重点实验室及工程研究中心、国家和省部级创新团队和教学团队优势，立足鄂尔多斯、聚焦内蒙古、辐射几字弯，聚焦清洁能源、资源环境、节能环保、地质工程、地理信息、智能装备、大数据等领域，在平台建设、科技攻关、成果转化、实验室和氢能产业学院共建，生态环境职业学院升格职业本科院校、人才培养、实习就业、专业提档升级，联合建立硕士博士研究生培养教育教学点、干部挂职等方面开展深入合作，围绕鄂尔多斯主导产业和重点领域开展技术攻关，解决产业发展中的技术难题和关键技术攻关，推动鄂尔多斯和学校高质量发展的重要举措。努力把研究院建设成为高水平新型研发机构、创新驱动发展重器和人才培养、科技创新基地，实现双方共赢发展。

实施三步走目标计划：研究院立足鄂尔多斯，聚焦内蒙古，辐射几字弯，实施“三步走”目标战略，即：2023-2026年,为鄂尔多斯区域高质量发展的新质力量；助力鄂尔多斯高等教育专业学科升级和人才培养质量提升,助推鄂尔多斯和学校事业高质量发展的高水平新型研究院。2027-2028年,服务鄂尔多斯区域创新驱动发展之重器；助推鄂尔多斯高等教育发展和人才培养的重要力量；国内高水平新型研究院。2028-2030年，成为鄂尔多斯区域教育-科技-人才一体化发展的重要支撑；卓越工程师培养基地、原始创新与关键技术策源地；国际知名国内一流新型研究院。